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LABORATORIO DE GENÓMICA DEL CÁNCER
Nuestro laboratorio se encuentra estudiando el papel de los factores epigenéticos en el daño del ADN, en su respuesta y mantenimiento de la integridad genómica, así como la búsqueda de oportunidades para terapias dirigidas a tumores sólidos, con especial atención al cáncer de mama y vesícula biliar.
Para esto, utilizamos distintas tecnicas de biología celular y molecular, como Inmunofluorescencia y microscopía, RT-qPCR, Western Blot, cromatina Inmuneprecipitación (ChIP), entre otras. Tambien nos encontramos utilizando secuenciación de próxima generación (NGS), utilizando MiSeq y Ion Torrent Plataforms.
Directora KATHERINE MARCELAIN, PHD
Licenciada en Medicina Veterinaria año obtención 1996. Médico Veterinario año de obtención 1998. Grado Doctor en Ciencias Biomédicas año de obtención 2003.
Equipo Científico
OTROS MIEMBROS DEL EQUIPO
Jessica Toro Carrasco
Profesional Bioquímica
Bioquímica de la Universidad de Santiago de Chile y Magíster en Docencia para la Educación Superior de la Universidad Andrés Bello. Actualmente, se desempeña como Asistente de investigación y coordinadora del área de secuenciación de última generación (NGS) en el Proyecto FONDEF IT16I10051 Tumor Sec: Optimización, validación y masificación de un ensayo de secuenciación de genes para mejorar la precisión de las terapias oncológicas.
Paola Gonzalez Moraga
Técnico de Laboratorio
Laboratorista Clínico, Banco de Sangre e Imagenología del Instituto Nacional de Capacitación (INACAP), actualmente se desempeña como Personal Técnico en Proyectos Fondef # 16I10051 y Proyecto Anillo ACT 17251.
Rodrigo Andaur Medina
Postdoc
Bioquímico de la Universidad de Santiago de Chile y PhD. en Bioquímica de la Universidad de Chile con la tesis "Efecto de dosis bajas de radiación ionizante en la expresión de miRNAs y su relación con la muerte de una línea celular de cáncer colorrectal", bajo la tutoría de la Dra. Katherine Marcelain y el Dr. Julio Tapia. Actualmente se desempeña como Investigador Post-Doctoral en el contexto del Proyecto Anillo ACT-172101
Hector Araya
Postdoc
Bioquímico egresado de la Universidad de Santiago de Chile. Doctor en Bioquímica de la Universidad de Chile. Actualmente se encuentra estudiando los efectos de la radiación de plasma pulsada en células cancerígenas. Desarrolla su investigación en el Laboratorio de Genómica del Cáncer bajo la dirección de la Dra. Katherine Marcelain.
Solange Rivas
Postdoc
Tecnólogo Médico con mención en Morfofisiopatología y Citodiagnóstico, de la Universidad Mayor y candidata a Doctora en Ciencias Biomédicas de la Universidad de Chile. El año 2011 realizó su tesis de pregrado titulada “Estudio de la degradación de la proteína Ski posterior a su fosforilación por el oncogén Aurora A”, bajo la dirección de la Dra. Katherine Marcelain. Actualmente, se desempeña como Asistente de Investigación en los proyectos FONDEF IT16I10051 y Anillo ACT 17251.
Ignacio Maureira
Investigador
Tecnólogo Médico con mención en morfofisiopatología y citodiagnóstico y Magíster (c) en Genética de la Universidad de Chile. Actualmente desarrolla su tesis de Magíster en el Proyecto FONDEF IT16I10051, específicamente en la identificación de genes blanco de terapia dirigida en cáncer colorrectal.
Jorge Lillo
Estudiante doctorado
Nicolás Miranda
Estudiante de Magister
Licenciado en Biotecnología de la Universidad de Antofagasta y estudiante de Magister en Genética en la Universidad de Chile. Actualmente realiza su tesis en área de secuenciación de última generación (NGS).
Francy Ramos Sanabria
Estudiante de Magíster
Tesista de Magíster Bióloga egresada de la Universidad del Tolima, Colombia. Actualmente estudiante de segundo año del Magíster en Genética de la Universidad de Chile. Desarrolla su tesis en el Laboratorio de Genómica del Cáncer bajo la dirección de la Dra. Katherine Marcelain.
Evelin Gonzalez
Ing. Bioinformática
Actualmente se desempeña como asistente de investigación en la identificación de variantes somáticas en cáncer en muestras clínicas en el proyecto FONDEF IT16I10051 y análisis de expresión diferencial de miARN para proyecto ANILLO ACT172101.
Nicolás Miranda
Tesista Pregrado
Leyla Zabib Jubis
Tesista Pregrado
Estudiante de Tecnología Médica, mención Morfofisiopatología y Citodiagnóstico de la Universidad del Desarrollo. Actualmente realiza su tesis de pre grado a cargo del Bioquímico PhD Rodrigo Andaur en el contexto del Proyecto Anillo ACT 17251.
PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN
| Código proyecto | Título proyecto | Inicio | Fin | Investigador principal / Coinvestigadores | Institución / Unidad académica principal | Programa | Fuente |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IT16I10051 | TumorSec: Optimización, validación y masificación de un ensayo de secuenciación de genes para mejorar la precisión de terapias oncológicas | 01-03-2017 | 01-03-2019 | K. Marcelain / R. Verdugo | UCH / Facultad de Medicina, Departamento de Oncología Básico _ Clínico, Departamento de Oncología Básico _ Clínico | FONDEF | IDEA |
| 1151446 | ADAR promotes breast cancer progression through the regulation of cell cycle and DNA repair related genes | 01-03-2015 | 01-03-2019 | R. Armisen / B. Muller; J. Tapia; K. Marcelain; R. Verdugo | Otras Instituciones/ Otras Instituciones, Otras Instituciones | FONDECYT | Regular |
| 1151435 | Role of Ski/Smad4 complex on the establishment of epigenetic modifications of pericentromeric chromatin required for proper chromosome segregation | 01-03-2015 | 01-03-2019 | K. Marcelain / R. Armisen; R. Assar | UCH / Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Genética Humana | FONDECYT | Regular |
| EQM140157 | NextSeq 5000 Sequencing System | 01-11-2014 | 01-11-2015 | R. Verdugo / A. Couve; B. Urzua; C. Araneda; C. Larrañaga; J. Aguillon; K. Marcelain; L. Cifuentes; L. Herrera; L. Jara; M. Bustamante; P. Olguín; R. Armisen; R. Ramires; S. Lavandero | UCH / Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Genética Humana | FONDEQUIP | Concurso de Equipamiento Científico |
| EQM130042 | Plataforma de microscopía confocal para uso en investigaciones biomédicas avanzadas | 01-12-2013 | 01-12-2014 | L. Leyton / A. Criollo; A. Paula; D. Bravo; E. Jaimovich; G. Diaz; K. Marcelain; M. Behrens; M. Chiong; M. Vega; S. Buvinic; S. Lavandero; U. Kemmerling; V. Torres | UCH / Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Biología Celular y Molecular | FONDEQUIP | Concurso de Equipamiento Científico |
| Act-1115 | Física de Plasma, Potencia Pulsada y Biología Celular para Energía, Vida y Medio Ambiente | 01-10-2012 | 01-10-2015 | L. Soto / A. Tarifeño; C. Pavez; G. Aravía; G. Gutiérrez; J. Moreno; J. Tapia; K. Marcelain; L. Huerta; M. Zambra; R. Armisen | Comisión Chilena de Energía Núclear/ Comisión Chilena de Energía Núclear, Comisión Chilena de Energía Núclear | Programa de Investigación Asociativa | Concurso Anillos en Ciencia y Tecnologia |
| 1120222 | Ski-containing transciptional co-repressor complexes on mitotic chromosomes repress the expression of selected target genes at early G1 | 01-03-2012 | 01-03-2015 | K. Marcelain / R. Armisen; U. Urzua | UCH / Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Genética Humana | FONDECYT | Regular |
| 1120286 | The transient receptor potential melastatin 4 (TRPM4) channel stabilizes beta-catenin and therefore enhances cell proliferation through a calcium-dependent negative regulation of GSK-3beta activity | 01-03-2012 | 01-03-2015 | R. Armisen / J. Tapia; K. Marcelain | UCH / Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Fisiopatología | FONDECYT | Regular |
| UR-11-XI | Red de medicina traslacional en Cáncer (U-CANCER) | 01-11-2011 | 01-11-2012 | R. Armisen / A. Quest; A. Villavicencio; C. Fernández; E. Castellon; F. ALONSO; F. Salazar; H. Contreras; I. Gallegos; J. Fernández; J. Tapia; K. Marcelain; M. Ahumada; M. Galindo; M. Lopez; O. Barajas; V. Cristi; V. Torres | UCH / Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Fisiopatología | Fondo Central de Investigación | Programa U-Redes: Línea 2 incentivo a la Consolidación de Red; Domeyko II |
| I07/11-2 | La quinasa Aurora-A fosforila Ski induciendo su degradación proteosomal durante la mitosis | 01-10-2007 | 01-10-2009 | K. Marcelain | UCH / Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Genética Humana | Fondo Central de Investigación | INICIACION |
PUBLICACIONES
| Autores | Título publicación | Año | Título revista | Tipo publicación | Digital object identifier |
|---|---|---|---|---|---|
| Sagredo, AI; Sagredo, EA; Pola, V; Echeverria, C; Andaur, R; Michea, L; Stutzin, A; Simon, F; Marcelain, K; Armisen, R | TRPM4 channel is involved in regulating epithelial to mesenchymal transition, migration, and invasion of prostate cancer cell lines | 2019 | JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1002/jcp.27371 |
| Sagredo, EA; Blanco, A; Sagredo, AI; Perez, P; Sepulveda-Hermosilla, G; Morales, F; Muller, B; Verdugo, R; Marcelain, K; Harismendy, O; Armisen, R | ADAR1-mediated RNA-editing of 3 ‘ UTRs in breast cancer | 2018 | BIOLOGICAL RESEARCH | ISI;SCOPUS;SCIELO-Chile/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1186/s40659-018-0185-4 |
| Andaur R., Tapia J.C., Moreno J., Soto L., Armisen R., Marcelain K. | Differential miRNA expression profiling reveals miR-205-3p to be a potential radiosensitizer for low- dose ionizing radiation in DLD-1 cells | 2018 | ONCOTARGET | SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.25405 |
| Jain J., Moreno J., Andaur R., Armisen R., Avaria G., Bora B., Davis S., Pavez C., Marcelain K., Soto L. | In vitro irradiation of colorectal cancer cells by pulsed radiation emitted from a hundred joules plasma focus device and its comparison with continuous irradiation | 2018 | Journal of Physics: Conference Series | SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1088/1742-6596/1043/1/012047 |
| Aracena, M; Cares, C; Arredondo, S; Marcelain, K; Gonzalez-Hormazabal, P | NIJMEGEN BREAKAGE SYNDROME: FOLLOW UP OF SEVEN CASES IN CHILE | 2018 | AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A | ISI/UCH/VID | |
| Sagredo, AI; Sagredo, EA; Cappelli, C; Baez, P; Andaur, RE; Blanco, C; Tapia, JC; Echeverria, C; Cerda, O; Stutzin, A; Simon, F; Marcelain, K; Armisen, R | TRPM4 regulates Akt/GSK3-beta activity and enhances beta-catenin signaling and cell proliferation in prostate cancer cells | 2018 | MOLECULAR ONCOLOGY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1002/1878-0261.12100 |
| Jain, J; Moreno, J; Andaur, R; Armisen, R; Morales, D; Marcelain, K; Avaria, G; Bora, B; Davis, S; Pavez, C; Soto, L | Hundred joules plasma focus device as a potential pulsed source for in vitro cancer cell irradiation | 2017 | AIP ADVANCES | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1063/1.4994655 |
| Bermejo, JL; Boekstegers, F; Silos, RG; Marcelain, K; Benavides, PB; Ponce, CB; Muller, B; Ferreccio, C; Koshiol, J; Fischer, C; Peil, B; Sinsheimer, J; Guajardo, MF; Barajas, O; Gonzalez-Jose, R; Bedoya, G; Bortolini, MC; Canizales-Quinteros, S; Gallo, C; Linares, AR; Rothhammer, F | Subtypes of Native American ancestry and leading causes of death: Mapuche ancestry-specific associations with gallbladder cancer risk in Chile | 2017 | PLOS GENETICS | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1006756 |
| Urzua, U; Chacon, C; Lizama, L; Sarmiento, S; Villalobos, P; Kroxato, B; Marcelain, K; Gonzalez, MJ | Parity History Determines a Systemic Inflammatory Response to Spread of Ovarian Cancer in Naturally Aged Mice | 2017 | AGING AND DISEASE | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.14336/AD.2017.0110 |
| Signore, IA; Jerez, C; Figueroa, D; Suazo, J; Marcelain, K; Cerda, O; Flores, AC | Inhibition of the 3-Hydroxy-3-Methyl-Glutaryl-CoA Reductase Induces Orofacial Defects in Zebrafish | 2016 | BIRTH DEFECTS RESEARCH PART A-CLINICAL AND MOLECULAR TERATOLOGY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1002/bdra.23546 |
| Bora B., Jain J., Inestrosa-Izurieta M.J., Avaria G., Moreno J., Pavez C., Marcelain K., Armisen R., Soto L. | Development of plasma needle to be used for biomedical applications | 2016 | Journal of Physics: Conference Series | SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1088/1742-6596/720/1/012038 |
| Jain J., Moreno J., Avaria G., Pavez C., Bora B., Inestrosa Izurieta M.J., Diez D., Alvarez O., Tapia J., Marcelain K., Armisen R., Soto L. | Characterization of x-rays pulses from a hundred joules plasma focus to study its effects on cancer cells | 2016 | Journal of Physics: Conference Series | SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1088/1742-6596/720/1/012043 |
| Rivas, S; Armisen, R; Rojas, DA; Maldonado, E; Huerta, H; Tapia, JC; Espinoza, J; Colombo, A; Michea, L; Hayman, MJ; Marcelain, K | The Ski Protein is Involved in the Transformation Pathway of Aurora Kinase A | 2016 | JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1002/jcb.25275 |
| Bermejo, JL; Silos, RG; Pell, B; Marcelain, K; Fuentes, M; Rothhammer, F | Genetic Ancestry and Mortality in Chile | 2015 | HUMAN HEREDITY | ISI/UCH/VID | |
| Bermejo, JL; Boekstegers, F; Silos, RG; Marcelain, K; Guajardo, MF; Rothhammer, F | Latino does not equal Latino: Major components of Native American Ancestry and Mortality due to Gallbladder Cancer in Chile | 2015 | GENETIC EPIDEMIOLOGY | ISI/UCH/VID | |
| Urzua, U; Chacon, C; Sarmiento, S; Lizama, L; Ampuero, S; Marcelain, K; Villalobos, P; Gonzalez, MJ; Romero, C | PARITY MODULATES THE OVARIAN TRANSCRIPTOME AND SYSTEMIC INFLAMMATORY MARKERS IN ESTROPAUSAL MICE | 2015 | INTERNATIONAL JOURNAL OF GYNECOLOGICAL CANCER | ISI/UCH/VID | |
| Niechi, I;Silva, E;Cabello, P;Huerta, H;Carrasco, V;Villar, P;Cataldo, LR;Marcelain, K;Armisen, R;Varas-Godoy, M;Fernandez, C;Tapia, JC | Colon cancer cell invasion is promoted by protein kinase CK2 through increase of endothelin- converting enzyme-1c protein stability | 2015 | ONCOTARGET | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.5722 |
| Cappelli, C;Urzua, U;Toro, J;Cassanova, E;Vargas, C;Donoso, G;Rivas, S;Orostica, K;Verdugo, R;Armisen, R;Marcelain, K | The transcriptional co-repressor Ski localizes in the pericentromeric region of mitotic chromosomes, regulating the expression of targeted genes at the early G1 phase of the cell cycle | 2014 | FEBS JOURNAL | ISI/UCH/VID | |
| Meruane, M.; Benítez, S.; Rojas, M.; Sagredo, A.; Marcelain, K.; Villalobos, B. | Epitelización inducida por células troncales derivadas del tejido adiposo | 2014 | CIRUGIA PLASTICA IBERO-LATINOAMERICANA | SCOPUS;SCIELO-otrospaises/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.4321/S0376-78922014000200001 |
| Sagredo, A;Sagredo, E;Salamanca, E;Luco, C;Andaur, R;Michea, L;Simon, F;Tapia, J;Marcelain, K;Armisen, R | The TRPM4 channel regulates the Epithelial-Mesenchymal transition in prostate cancer cells | 2014 | FEBS JOURNAL | ISI/UCH/VID | |
| Arredondo, S; Aracena, M; Cares, C; Marcelain, K; Gonzalez-Hormazabal, P; Pincheira, J | Heterogeneity of Immune Abnormalities in Children with Nijmegen Breakage Syndrome: Experience in a Single Center | 2013 | JOURNAL OF CLINICAL IMMUNOLOGY | ISI/UCH/VID | |
| Colombo, A;Palma, K;Armijo, L;Mione, M;Signore, IA;Morales, C;Guerrero, N;Meynard, MM;Perez, R;Suazo, J;Marcelain, K;Briones, L;Haartel, S;Wilson, SW;Concha, ML | Daam1a mediates asymmetric habenular morphogenesis by regulating dendritic and axonal outgrowth | 2013 | DEVELOPMENT | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1242/dev.091934 |
| Marcelain, K;Armisen, R;Aguirre, A;Ueki, N;Toro, J;Colmenares, C;Hayman, MJ | Chromosomal Instability in Mouse Embryonic Fibroblasts Null for the Transcriptional Co-Repressor Ski | 2012 | JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1002/jcp.22733 |
| Meruane, MA;Rojas, M;Marcelain, K | The Use of Adipose Tissue-Derived Stem Cells within a Dermal Substitute Improves Skin Regeneration by Increasing Neoangiogenesis and Collagen Synthesis | 2012 | PLASTIC AND RECONSTRUCTIVE SURGERY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1097/PRS.0b013e3182547e04 |
| Armisen, R ; Marcelain, K ; Simon, F ; Tapia, JC ; Toro, J ; Quest, AFG ; Stutzin, A | TRPM4 Enhances Cell Proliferation Through Up-Regulation of the beta-Catenin Signaling Pathway | 2011 | JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1002/jcp.22310 |
| Mosquera, J ; Armisen, R ; Zhao, HL ; Rojas, DA ; Maldonado, E ; Tapia, JC ; Colombo, A ; Hayman, MJ ; Marcelain, K | Identification of Ski as a target for Aurora A kinase | 2011 | BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1016/j.bbrc.2011.05.040 |
| Yefi, R;Ponce, DP;Niechi, I;Silva, E;Cabello, P;Rodriguez, DA;Marcelain, K;Armisen, R;Quest, AFG;Tapia, JC | Protein Kinase CK2 Promotes Cancer Cell Viability Via Up-Regulation of Cyclooxygenase-2 Expression and Enhanced Prostaglandin E2 Production | 2011 | JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1002/jcb.23247 |
| Ponce, DP;Yefi, R;Cabello, P;Maturana, JL;Niechi, I;Silva, E;Galindo, M;Antonelli, M;Marcelain, K;Armisen, R;Tapia, JC | CK2 functionally interacts with AKT/PKB to promote the beta-catenin-dependent expression of survivin and enhance cell survival | 2011 | MOLECULAR AND CELLULAR BIOCHEMISTRY | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1007/s11010-011-0965-4 |
| Zhao, HL ; Ueki, N ; Marcelain, K ; Hayman, MJ | The Ski protein can inhibit ligand induced RAR alpha and HDAC3 degradation in the retinoic acid signaling pathway | 2009 | BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1016/j.bbrc.2009.03.141 |
| Pincheira, J ; Romero, P ; Marcelain, K ; Salazar, L ; de la Torre, C | G2 checkpoint-dependent DNA repair and its response to catalase in Down syndrome and control lymphocyte cultures | 2007 | CELL BIOLOGY INTERNATIONAL | ISI;SCOPUS/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.1016/j.cellbi.2006.09.018 |
| Marcelain, K; De La Torre, C; Gonzalez, P | Roles of nibrin and ATM/ATR kinases on the G2 checkpoint under endogenous or radio-induced DNA damage | 2005 | BIOLOGICAL RESEARCH | ISI;SCOPUS;SCIELO-Chile/UCH/VID | http://dx.doi.org/10.4067/S0716-97602005000200007 |
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